يمارس المركز نشاطه من أجل تحقيق الأهداف الآتية

• 1 -السعي لأن يكون المركز مرجعاً علمياً موثوقاً في كل ما يختص بتاريخ عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة وحضارتهما العريقة، وثقافتهما وتراثهما.
• 2 - التنسيق مع المراكز الأخرى في اليمن والدول العربية والأجنبية ذات الاهتمامات المشابهة لاهتمامات المركز.
• 3 - الإسهام مع الجهات ذات العلاقة في تجميع المصادر التاريخية المتعلقة عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة: (وثائق ومخطوطات وكتب) في داخل اليمن وخارجها، وحصرها والعناية بها .
• 4 - رصد الأمكنة التاريخية القائمة، وتحديد أهميتها التراثية والحضارية والتاريخية، وتوثيقها.
• 5 - التواصل مع الباحثين والمهتمين بالمجالات التاريخية، والحضارية، للإسهام في تأصيل هذه المجالات، والكشف عن حقائقها التاريخية، وأهميتها الحضارية، من أجل إبرازها ونشرها للفائدة العامة.
• 6 - تنفيذ ورش عمل، وحلقات نقاش، وندوات علمية، ومؤتمرات في مختلف الجوانب التاريخية والحضارية.
• 7 - استضافة الشخصيات العربية والدولية المهتمة بدراسة تاريخ المنطقة.
• 8 - إنشاء جوائز بحثية سنوية بأسماء شخصيات داعمة والإشراف عليها في المجالات الآتية: الهجرة، والموروث الشعبي، والفنون المعمارية، والتراث البحري، والفلكي، والتراث الزراعي، والحرف الشعبية، والطب البديل، والترجمة وغيرها.
• 9 - رصد رسائل الماجستير والدكتوراه، التي بحثت في تاريخ المنطقة، وطباعة ونشر ما تجيزه إدارة البحوث، سواء قُدمت في جامعات عربية، أو أجنبية.
• 10 - إصدار بعض المجلات العلمية المتخصصة، تهتم بنشر البحوث والدراسات التاريخية والحضارية.
• 11 - تسجيل ذاكرة الشخصيات الرائدة والمعمرة في عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة، في كافة المجالات.
• 12 - طباعة المؤلفات التي تُعنى بتاريخ عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة ونشرها من خلال التواصل مع المؤلفين والمترجمين وتشجيعهم.
• 13 - تأسيس قاعدة بيانات معلوماتية تاريخية حول ما يتعلق عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة.
• 14 - إجراء مسح شامل للأرشيف التاريخي لعدن بخاصة وللوطن بعامة في مختلف المراحل تمهيداً لأرشفته وإتاحته للباحثين .
• 15 - المتابعة المستمرة لما ينشر عن تاريخ عدن وحضارتها باللغات الأجنبية، وترجمة ما يحقق أهداف المركز.
• 16 - تقديم الدعم والاستشارة العلمية للباحثين في حقول تاريخ عدن بخاصة وجنوب اليمن بعامة.

• 1 - الإدارة العامة لموسوعة الجنوب العربي.
• 2 - إدارة البحوث والدراسات.
• 3 - إدارة المؤتمرات والترجمة.
• 4 - إدارة الثقافة والإعلام.
• 5 - إدارة الوثائق والمخطوطات.
• 6 - إدارة التوثيق التلفزيوني.
• 7 - إدارة الشؤون المالية والإدارية.
• 8 - إدارة العلاقات العامة والحكومية.
• 9 - إدارة الطباعة والنشر والتوزيع .